Sau năm 1945, Phổ Ninh là một xã thuộc huyện Đức Phổ.

Từ năm 1954 đến năm 1958, chính quyền Sài Gòn đổi tên xã Phổ Ninh thành xã Phổ Bình thuộc quận Đức Phổ. Chính quyền cách mạng vẫn gọi là xã Phổ Ninh như cũ.

Sau năm 1975, xã Phổ Ninh thuộc huyện Đức Phổ.

Ngày 12 tháng 3 năm 1987, điều chỉnh một phần diện tích và dân số của xã Phổ Ninh để thành lập thị trấn Đức Phổ.[2]

Ngày 10 tháng 1 năm 2020, thành lập phường Phổ Ninh thuộc thị xã Đức Phổ trên cơ sở toàn bộ 22,25 km2 diện tích tự nhiên và 9.395 người của xã Phổ Ninh.[1]